Page 33 - Hekim Sözü - Sayı 11 - Eylül-Ekim 2020
P. 33

DOSYA


            salların (nörotransmitter) sentezinde rol   epitel hücrelerinde anlatım yaptığında bu
            oynayan PRODH geninde görülmektedir.   gen mezenşimal dönüşümü tetiklemekte   KAYNAKLAR
                                                                                      Anwar SL, Wulaningsih W, Lehmann U.
            Bu gen en çok beynin hipokampüs bölge-  ve tümör agresifliğini ve metastazını artır-  Transposable elements in human cancer:
                                                                                      causes and consequences of deregulation.
            sine özgü olarak anlatım yapmakta ve bu   maktadır. HERV-K’nın anlatımı pek çok   Int. J. Mol. Sci. 2017; 18:E974.
            anlatım biçimi yine endojen bir retrovirüs   başka gen işlevi başlatıcı devreye sokarak   Bae EH ve Jung YT. Comparison of the effe-
                                                                                      cts of retroviral restriction factors involved in
            olan HERV-K’nin düzenlemesiyle gerçek-  hücresel dönüşümün gerçekleşmesini teş-  resistance to porcine endogenous retrovirus.
                                                                                      J. Microbiol. Biotechnol. 2014;  24: 577–583
            leşmektedir. Daha ilginç bir bulgu olarak   vik etmektedir (Lemaître C ve diğ. 2017)   Bar-On YM, Phillips R, Milo R. The bio-
                                                                                      mass distribution on Earth Proc Natl Acad
            PRODH geni şizofreni ve diğer bazı nöro-  Benzer şekilde farklı türde kanserlerde   Sci U S A . 2018; 115(25):6506-6511.
            lojik bozukluklarla ilişkilendirilmektedir.   anlatımları 3000 kat kadar artan, değişen   Buzdin A, Kovalskaya-Alexandrova E,
                                                                                      Gogvadze E, Sverdlov E. At least 50% of
            Bu nedenle PRODHgeniyle HERV-K’nın   ve kanser hücrelerinin devamlılığında   human-specific HERV-K (HML-2) long
                                                                                      terminal repeats serve in vivo as active pro-
            etkileşimi insanın merkezi sinir sisteminin   rol oynayan pek çok endojen retrovirüs   moters for host nonrepetitive DNA transcrip-
                                                                                      tion. J. Virol. 2006; 80: 10752–10762
            evrimine katkı sağlamış olabilir. (Suntso-  keşfedilmiştir. (Anwar SL ve diğ. 2017)   Buzdin A. Human-specific endogenous
                                                                                      retroviruses. ScientificWorld Journal 2007;
            va M ve diğ. 2013)                  Bir motor nöron hastalığı olan Amyot-  7: 1848–1868.
                                                rofik Lateral Skleroz’da, şizofreni de ve   Cordaux R, Hedges, DJ, Herke, SW,  Batzer
                                                                                      MA. Estimating the retrotransposition
            Endojen virüslerin sunduğu evrimsel   bipolar bozukluklar da endojen retroviral   rate of human Alu elements. Gene 2006;
            avantajlardan biri de kendilerinin ürünü   aktivitede ciddi ölçüde artış görülmüş-  373: 134–137.
            olan proteinlerin bir anti-viral olarak işlev   tür ve örneğin ALS benzeri durumların   Callinan PA ve Batzer M A Retrotranspo-
                                                                                      sable elements and human disease. Genome
            görerek konağı dışarıdan gelecek benzer   tedavisinde anti-viral ilaçların iyileşmede   Dyn. 2006; 1: 104–115
                                                                                      Dewannieux M, ve  Heidmann T. Endoge-
            virüslere karşı korumasıdır. Endojen ret-  önemli payı olduğu görüşmüştür. (Liu Y   nous retroviruses: acquisition, amplification
                                                                                      and taming of genome invaders. Curr.
            rovirüslerin ürettiği env proteini normalde   ve diğ. 2019)               Opin. Virol. 2013; 3: 646–656
            virüsün hücre içine girerken kullanacağı                                  Edward BC, Nels CE, Cédric F. Regulatory
                                                                                      evolution of innate immunity through
            reseptörü bloke eder. Dolayısıyla kabaca   Endojen retrovirüslerden farklı olarak   co-option of endogenous retroviruses. Science
                                                                                      2016; 351(6277):1083-7
            içinde yer aldığı hücrenin sahibiymiş gibi   hali hazırda bizimle dışarıdan etkileşen   Emera D, Casola C, Lynch VJ, Wildman
                                                                                      DE, Agnew D, Wagner GP. Convergent
            davranarak aynı reseptörü kullanan başka   ve diyelim hastalıklara yol açan virüslerin   evolution of endometrial prolactin expression
                                                                                      in primates, mice, and elephants through the
            virüslerin içeri girmesini engellemiş olur.   insan evrimine etkisine ilişkin yapılan   independent recruitment of transposable ele-
                                                                                      ments. Mol. Biol. Evol. 2012; 29: 239–247
            Bu tür endojen retrovirüslere sahip olan   çalışmalar genellikle doğrudan bağışıklık   Enard D, Cai L, Gwennap C, Petrov
            popülasyon dışarıdan gelen yeni virüslere   sisteminde rolü olan tek tek proteinler   DA. Viruses are a dominant driver of
                                                                                      protein adaptation in mammals Elife 2016;
            karşı doğal seçilime uğrayabilir. İnsan-  üzerine olmaktadır. Bunun böyle olması   5:e12469
                                                                                      Frendo JL, Olivier D, Cheynet V, et al.
            da bulunan Supresin proteini HERV-F   mantıklıdır zira virüslerin neden olduğu   Direct involvement of HERV-W Env gly-
                                                                                      coprotein in human trophoblast cell fusion
            endojen retrovirüsü tarafından üretilmekte   evrimsel uyarlanımların görülebileceği en   and differentiation. Mol. Cell. Biol. 2003;
                                                                                      23: 3566–3574
            ve benzer bir süreci yönettiği düşünül-  makul moleküller virüslere karşı savaşmak   Garazha A, Ivanova A, Suntsova M, et al.
            mektedir. (Malfavon-Borja R ve Feschotte   için üretilen bu proteinlerdir. Öte yandan   New bioinformatic tool for quick identifi-
                                                                                      cation of functionally relevant endogenous
            C. Fighting, 2015) Endojen retrovirüslerin   yakın bir zaman önce bu sürece daha   retroviral inserts in human genome. Cell
                                                                                      Cycle; 2015: 14, 1476–1484.
            bir virüs enfeksiyonundan sonra üretilen   geniş bir pencereden bakarak yapılan bir   Gonzalez-Hernandez MJ, Cavalcoli JD,
                                                                                      Sartor MA, et al. Regulation of the human
            ve tehlikeyi haber veren moleküller olan   çalışmada genom dizisi ortaya çıkarılmış   endogenous retrovirus K (HML-2) transc-
                                                                                      riptome by the HIV-1 Tat protein. J. Virol.
            interferonlarla etkileştiğinde AIM2 adlı   olan memelilerde virüslerle fiziksel etkile-  2014; 88: 8924–8935.
            bir geni etkinleştirdiği ve böylece enfekte   şime giren tüm proteinler mevcut literatür   Kelkar YD, Tyekucheva S, Chiaromonte F,
                                                                                      Makova KD. The genome-wide determinants
            hücreyi istilacı virüslerin olgunlaşmasını   taranarak tanımlanmış ve 9900 protein   of human and chimpanzee microsatellite
                                                                                      evolution. Genome Res. 2008; 18: 30–38 ().
            engellemek üzere yıkıma götürdüğü gös-  arasından 1300 proteinin evrimi virüs-  Lander ES , Linton LM,  Birren B, C. et al.
                                                                                      Initial sequencing and analysis of the human
            terilmiştir. Buna göre endojen retrovirüs-  lerle etkileşmeyen proteinlerin evrimiyle   genome. Nature 2001; 409: 860–921
            lerin interferon etkisi altında çalışan gen   karşılaştırılmıştır. Buna göre etkileşim   Lemaître C, Tsang J, Bireau C, Heidmann
                                                                                      T, Dewannieux M A human endogenous
            anlatım ağının evrimini şekillendirdiği   içinde bulunan proteinlerdeki evrimsel   retrovirus-derived gene that can contribute to
                                                                                      oncogenesis by activating the ERK pathway
            söylenebilir. (Edward BC ve diğ, 2016)   uyarlanımın diğerlerine göre üç kat daha   and inducing migration and invasion PLoS
                                                                                      Pathog. 2017;13(6):e1006451
            Bununla ters yönde bir etkiye örnek ola-  fazla olduğu görülmüştür. (Enard D ve   Liu Y, Russ J, Cali CP, Phan JM, Am-
                                                                                      lie-Wolf A, Lee  EB Loss of Nuclear TDP-43
            rak HIV virüsüyle enfekte olan insanlarda   diğ. 2016) Bu durum, uyarlanımların neye   Is Associated with Decondensation of LINE
                                                                                      Retrotransposons Elaine Cell Rep. 2019;
            HERV-K ile beraber 25 başka retrovirüsün   yol açtığı daha ileri araştırmalarla ortaya   27(5):1409-1421.e6.
                                                                                      Malfavon-Borja R ve Feschotte C. Fighting
            de etkin hale geçtiği bildirilmektedir.   çıkacak olsa da, virüslerin bizi yalnızca   fire with fire: endogenous retrovirus envelo-
            (Gonzalez-Hernandez MJ ve diğ. 2014)   onlara karşı savaşta kullandığımız meka-  pes as restriction factors. J. Virol. 2015; 89:
                                                                                      4047–4050
            Dolayısıyla virüs, endojen retrovirüs ve   nizmalar bakımından değil göz ardı ettiği-  Suntsova M, Gogvadze E, Salozhin S, et al.
                                                                                      Human-specific endogenous retroviral insert
                                                miz başka hücresel ve sistemsel nitelikle-
            insan etkileşimi oldukça karmaşık bir                                     serves as an enhancer for the schizophre-
                                                                                      nia-linked gene PRODH. Proc. Natl. Acad.
            ilişkiler ağı içinde yürümektedir.    rimiz bakımından da şekillendirdiğini ve   Sci. U.S.A. 2013; 110: 19472–19477
                                                virüsle etkileşimimizin evrimimizde çok   The new scope of virus taxonomy: parti-
            Daha önce belirtildiği gibi endojen retro-  daha kapsamlı bir rol oynadığını ortaya   tioning the virosphere into 15 hierarchical
                                                                                      ranks 2020 International Committee on
            virüsler yarattıkları genomik kararsızlık   koymaktadır. Neden başka şekilde değil   Taxonomy of Viruses Executive Committee
                                                                                      2020; 5(5):668-674
            nedeniyle bazı hastalıkların gelişiminde   de bu şekilde evrimleştiğimizin anlaşılma-  Ting CN, Rosenberg MP, Snow CM, Samu-
                                                                                      elson LC, Meisler MH. Endogenous retrovi-
            de rol oynamaktadır. Yakın zaman önce   sında virüslerin sandığımızdan çok daha   ral sequences are required for tissue-specific
                                                                                      expression of a human salivary amylase
            yapılan bir çalışmada yukarıda da adı   fazla etkili olduğu her yeni araştırmayla   gene. Genes Dev. 1992; 6: 1457–1465
            geçen HERV-K’nın kanser yapıcı etkiye   birlikte çok daha açık bir şekilde ortaya   Young JM, Whiddon JL, Yao Z, et al.
                                                                                      DUX4 binding to retroelements creates pro-
            sahip olduğu gösterilmiştir. İnsan meme   çıkmaktadır.                    moters that are active in FSHD muscle and
                                                                                      testis. PLoS Genet 2013; 9:e1003947
                                                                                     EYLÜL-EKİM 2020  hekim sözü  31
   28   29   30   31   32   33   34   35   36   37   38